质粒全测序(7000bp内)实验技术介绍

如期分享 1周前 (04-29) 阅读数 0 #科技

质粒全测序(7000bp内)实验技术介绍

一、技术概述

质粒全测序是通过一代测序技术(Sanger测序)对质粒DNA的完整序列进行精准解析,确保质粒构建的正确性、插入片段的完整性及无突变存在。本实验结合高纯度质粒小提试剂盒(TIANpure Mini Plasmid Kit)提取高纯度质粒DNA,并通过多轮引物步移测序策略,覆盖质粒全序列,为基因克隆、载体验证及功能研究提供可靠数据支持。  二、实验目的

1. 验证质粒构建:确认插入片段序列、方向及连接位点无突变;

2. 检测载体完整性:确保质粒骨架(如启动子、抗性基因)无意外缺失或插入;

3. 辅助功能研究:为基因表达、蛋白互作及转基因实验提供精准序列信息。

三、实验流程

1. 质粒提取

基于TIANpure Mini Plasmid Kit进行质粒提取(详情参见试剂盒说明书)

2. 测序引物设计与测序

a. 通用引物初测:使用载体通用引物(如T7/SP6)对插入片段两端进行初步测序;

b. 步移引物设计:根据初测结果设计新引物,逐步延伸覆盖全长序列;

c. 测序反应:采用Sanger测序法,通过荧光标记ddNTP终止扩增,生成测序峰图;

d. 序列拼接:将多段测序结果拼接为完整质粒序列,确保无缺口或矛盾位点。

四、技术优势

✅  精准测序:一代测序准确率>99.9%,可检测单碱基突变

✅  灵活覆盖 :支持多轮引物步移,适配复杂载体或长片段插入

✅  高纯度质粒:通过高纯度试剂盒提取质粒,适用于敏感实验(如转染、测序)

五、适用范围

1️⃣ 基因克隆验证:重组质粒插入片段与载体连接位点确认

2️⃣ 突变体筛选:定点突变或随机突变文库的序列鉴定

3️⃣ 合成生物学:人工合成质粒的功能元件完整性检测

4️⃣ 科研与工业应用:GMP级质粒生产质控、疫苗研发载体验证

六、代表性实验结果

七、提供

1 细胞样品: >2×107;细胞培养上清≥1ml

动植物组织/细菌、真菌样品: >100mg(黄豆粒大小);

血清、血浆、全血及其他体液样品: >200μl;

RNA/DNA/cDNA:  v≥10μl,c≥50ng/μl

2 物种信息及基因信息

(注:组织样品需液氮速冻、保存于-80度,样品使用干冰寄送)

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