SNP检测实验技术介绍

SNP检测实验技术介绍

一、技术概述

单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism, SNP）是基因组中单个碱基的变异，在人类基因组中广泛存在，与疾病易感性、药物反应及个体化医疗等密切相关。通过特异性探针或深度测序精准识别SNP位点，提供基因分型、等位基因频率及功能预测分析，助力遗传机制研究与临床转化应用。

二、实验目的

通过检测样本中目标SNP位点的基因型（如AA、AG、GG），分析其与表型（疾病、药物疗效、性状等）的关联性，为疾病研究、个体化用药等领域提供数据支持。

三、实验流程

1、DNA抽提

取200ul全血至1.5mL离心管中，严格按照“TIANamp Genomic DNA Kit”试剂盒说明书步骤进行提取。

2、PCR扩增

1）将Mix在4℃下融解，轻柔地上下颠倒混匀并进行短暂离心。

2）冰上配制下表中的反应液

成分 加入量 终浓度

PrimeSTAR Max Premix（2X） 15μL 1×

Forward Primer (10μM) 0.6μL 0.2 μM

Reverse Primer (10μM) 0.6μL 0.2 μM

DNA 100 ng

RNase-free Water To30μL

3）将反应管进行短暂离心，确保所有反应液在反应孔底部。

4）采用三步法程序进行反应：

循环数 步骤 温度 时间

40 预变性 98℃ 10s

变性 55℃ 5s

退火 72℃ 5s

3、定量测序

四、技术优势

✅ 高通量：单次实验可分析数百至数万样本

✅ 支持单个位点检测（TaqMan）或大规模筛查（测序芯片）

✅ 广泛兼容：适用于低浓度DNA样本。

五、适用范围

1️⃣ 临床诊断

2️⃣ 药物基因组学

3️⃣ 农业育种

4️⃣ 肿瘤研究

六、代表性实验结果

七、提供

1 细胞样品: ＞2×107；细胞培养上清≥1ml

动植物组织/细菌、真菌样品: ＞100mg（黄豆粒大小）；

血清、血浆、全血及其他体液样品: ＞200μl；

RNA/DNA/cDNA:  v≥10μl，c≥50ng/μl

2 物种信息及基因信息

（注：组织样品需液氮速冻、保存于-80度，样品使用干冰寄送）