一开始大家以为新冠只是肺病，后来医生发现它也会损伤大脑。美国 NIH 神经科学家 Avindra Nath 在 2020 年调查纽约多起离奇猝死案例：死者心肺没有明显损伤，却突然停止呼吸。检查发现，脑干中控制呼吸的区域出现神经元流失。很多康复者出现呼吸不畅、失眠、脑雾、疲劳、情绪与自主神经失调等症状，和慢性疲劳综合征高度相似，常被误解或难以有效治疗。Nath 认为，关键是脑干附近小血管和支持系统受损、持续发炎，影响思考、情绪、心跳、血压、消化等身体核心功能，症状不一定会自己好转。近年研究还显示：新冠不只是短期脑雾，还可能留下大脑结构与生化痕迹，提高长期失智风险；轻症也可能让大脑记忆、规划相关区域轻微萎缩；感染者一年后记忆力、决策力会小幅下降；感染数月到数年后，认知受损概率更高，部分老人血液中出现与阿尔茨海默症相关的蛋白信号。研究者普遍认为，新冠不一定直接导致阿尔茨海默症，但可能加速大脑退化。目前 NIH 已将长新冠视为免疫驱动的神经问题开展临床试验，尝试用免疫调节疗法控制长期炎症，帮助患者恢复功能。