南通轨道交通首条线路1号线于2022年11月10日开通运营，这样南通成为大陆第43座、江苏省第6座开通地铁的城市。 截至2024年12月，南通轨道交通运营线路共有2条，运营总里程约58.78千米。 南通地铁运营至今的上座率却很低，客运强度只有0.21（万人次每公里日），正常处于全国30多位，在江苏所有通地铁的城市中也是最差的，现在看来南通当初花巨资修建地铁与规划愿景差距还是很大的。 新的地铁申报要求是申报城市GDP不低于3000亿元、一般公共预算收入不低于300亿元、市区常住人口不低于300万，这三个条件南通都是符合的。 但是，针对多个城市建设地铁之后的运营情况，一座城市申报建设地铁除了满足以上三个条件之外，现在又增加了客运强度方面的要求，拟建地铁线路的初期客运强度需达到每日每公里0.7万人次以上，简单地说一条30公里的地铁，每天的客流应该在20万人以上，另外债务风险也是考核内容之一。 依据这个要求南通明显还有很大的差距，而现有的两条地铁是远远不能满足城市出行需求的，可地铁又是一次性投资巨大，收益缓慢的民生项目，南通计划新建的3号线早就上报审批，但至今并没有得到批复，依据现有地铁运行盈亏情况和客运强度这个新要求，大概率是不会通过审批的。 南通地铁目前规划了7条线路，已经建成了2条，3号线在审批，如果正常审批不能通过，那后期的地铁规划也就无从谈起了。