2005年1月30日，阿里埃勒·沙龙在办公室举行每周内阁会议时，表现出短暂沉默。2006年1月4日晚，沙龙再度突发中风，被紧急送往医院抢救，副总理奥尔默特暂时代行总理职权。 2005年12月18日晚上，阿里埃勒·沙龙感觉不适，被紧急送往医院进行脑扫描，医生们称是轻度中风，但生命没有危险，治疗后好转。2006年1月4日，沙龙出现严重脑出血，昏迷后再未苏醒，在特拉维夫谢巴赫康复中心接受治疗，靠呼吸机等辅助设备维持生命；同年1月9日，医疗人员开始逐步唤醒沙龙的工作后，沙龙开始自主呼吸，但此后一直处于昏迷，同年4月，以色列内阁宣布沙龙永久失去履行职权的能力，以色列政坛的“沙龙时代”至此正式结束。2007年4月，沙龙的病情有很大好转，他不仅可以通过轻微的握手行为来对各种问题做出反应，当天还首次在生病后开口讲话。2010年11月12日，沙龙在中风昏迷将近5年后，由亲属接回家中护理。 2013年1月27日，美以联合医疗队的专家表示经核磁共振扫描图像显示，沙龙突然表现出“一定程度的意识”。2014年1月初开始，阿里埃勒·沙龙的病情恶化，重要器官衰竭。 2014年1月11日，沙龙在已经中风昏迷8年后，于特拉维夫的谢巴赫医疗中心去世，享年85岁。2014年1月13日，以色列为阿里埃勒·沙龙举行了国葬。时任以色列总统佩雷斯、总理内塔尼亚胡、议长埃德尔斯坦等政府官员和议员，时任美国副总统拜登等外国政要和沙龙的家人、生前友好及以色列民众参加了政府为沙龙举行的国家悼念仪式。佩雷斯、内塔尼亚胡和拜登、布莱尔等分致悼词，怀念沙龙作为以色列军事家和政治家的一生。国家悼念仪式结束后，沙龙的灵柩由军方护送，被运往南部内盖夫地区沙龙家族的锡卡莫尔农场，埋葬在已故妻子莉莉的墓旁。