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变更基金会法定代表人后，通常需要在以下部门进行备案：

民政部门：基金会的登记管理机关是民政部门1。在完成法定代表人变更登记后，需将变更后的相关信息，如《法人登记证书》等文书向民政部门备案1。基金会应按照当地民政部门的要求，提交相关材料，如理事会决议、变更登记申请表、新法定代表人的身份证明等，以完成备案手续。

税务部门：需要到税务部门办理税务登记信息变更。准备《变更税务登记表》、变更后的工商营业执照复印件、税务登记证正副本原件、变更后的法定代表人身份证件复印件等材料。可以通过网上申请或现场办理的方式提交申请，不同地区的税务机关在具体要求和流程细节上可能存在差异，建议提前与当地税务机关沟通确认。

银行：基金会在银行开设的账户信息也需要进行变更。携带新的法人登记证书、法定代表人身份证明、变更通知书等相关证明文件到开户银行，办理法定代表人信息变更手续，以便后续资金往来等业务的正常开展。

质量技术监督部门（涉及组织机构代码证的情况）：如果基金会有组织机构代码证，且该证上登记的法定代表人信息需要变更，应填写企业代码证变更表格，加盖公章，整理公司变更通知书、营业执照副本复印件、企业法人身份证复印件、老的代码证件原件等材料，到质量技术监督局办理变更手续。不过，在很多地区，组织机构代码证已完成与营业执照的 “多证合一”，这种情况下一般无需单独办理组织机构代码证的变更。

此外，如果基金会有业务主管单位，还需向业务主管单位进行备案，将变更情况及相关材料报送业务主管单位，以便其了解和掌握基金会的变动情况1。